البيانات الوبائية المتعلقة بانتشار الصداع العنقودي غير مكتملة. جُمعت البيانات الأولية من قِبل الطبيب الباطني في برلين ورائد الصداع الألماني فون هيك (1976). وقدّر أن 6% من السكان يعانون من الشقيقة. ومن بين هؤلاء، يراجع ثلثهم الطبيب بسبب الصداع. واستنادًا إلى معلومات من عيادته، علم أن واحدًا من كل 50 مريضًا بالشقيقة تقريبًا يعاني من الصداع العنقودي. ومن هذه الأرقام، حسب هيك انتشار الصداع العنقودي بحوالي أربعة مرضى لكل 10,000 شخص. وقد تم الحصول على أرقام مماثلة من دراسة إيطالية قدّرت انتشار الصداع العنقودي بناءً على معدلات الاستشارة في مراكز متخصصة بالصداع. وحُسب أن ما بين واحد وأربعة أشخاص من كل 10,000 شخص يعانون من الصداع العنقودي.
أُجريت الدراسة السكانية الوحيدة حول انتشار الصداع العنقودي في سان مارينو من قِبل بيناسي وآخرون (1986). من بين 21,792 نسمة، وُجد 15 مريضًا تنطبق عليهم معايير تشخيص الصداع العنقودي، ما يُشير إلى انتشار بنسبة 0.07%. ونظرًا لكون سان مارينو جزيرة، ينبغي توخي الحذر عند تعميم هذه الأرقام على دول أخرى، ولكن بشكل عام، يبدو أن عدد المصابين بالصداع العنقودي أقل من مريض واحد لكل 1000 شخص، ما يُؤكد ندرة هذا النوع من الصداع.
الاختلافات الثقافية
لم يُفهم بعد بشكل كامل ما إذا كانت هناك اختلافات ثقافية في انتشار الصداع العنقودي. أشارت دراسة صينية إلى معدلات انتشار منخفضة للغاية للصداع العنقودي (0.006%). مع ذلك، ونظرًا للقيود المنهجية، ينبغي التعامل مع صحة هذا الرقم بحذر. ويشير باحثون آخرون إلى أن الصداع العنقودي أكثر شيوعًا بين الأمريكيين السود منه بين الأمريكيين البيض. ولم يُثبت هذا الأمر تجريبيًا أيضًا.
الاختلافات بين الجنسين
تُقدّم العديد من الدراسات الوبائية أدلة واضحة ومتسقة على أن الصداع العنقودي هو اضطراب الصداع الأولي الوحيد الذي ينتشر بشكل ملحوظ بين الرجال. وتتراوح تقديرات نسبة الرجال بين المرضى المصابين بالصداع العنقودي المزمن والمتقطع بين 70% و90%. ومع ذلك، فقد وجدت دراسات أحدث اختلافات أقل في معدل الانتشار بين الرجال والنساء، بنسبة تقارب 3:1.
